Ticket #748: iml-1.0.3.p0.diff

File iml-1.0.3.p0.diff, 16.2 KB (added by jdemeyer, 9 years ago)

  • SPKG.txt 

    # HG changeset patch
# User Jeroen Demeyer <jdemeyer@cage.ugent.be>
# Date 1371040536 -7200
# Node ID e4789dc8b03d111f9a5ce5eca1c854f7282b606a
# Parent  f50311951edb14bc77af9d025fbf66ea955b95a4
Trac #748: Upgrade to version 1.0.3.

diff --git a/SPKG.txt b/SPKG.txt
    a b  
    2727
    2828== Special Update/Build Instructions ==
    2929
    30  * Sage's current version is fairly out of date. As of June 2013, the
    31    latest upstream release is 1.0.3 (dated July 28th 2008).
    3230 * Various files should be made executable. Run spkg-src after
    3331   extracting the sources to src/ to fix this.
    3432
    3533=== Patches ===
    3634
    37  * rename_lift.patch: Change lift to iml_lift in padiclift.* and
    38    nonsingsolve.*, since otherwise  on OSX you'll have horrible weird
    39    conflict problems.
    40  * Modified some of the examples, and made build scripts that work.
     35 * blas_headers.patch: Add BLAS header files from GSL, needed in case
     36   ATLAS has not been installed.
     37 * build.patch: Made build scripts that work.
     38 * configure_default_cflags.patch: get rid of the following error
     39   during configure:
     40     ./configure: line 18624: -O3: command not found
     41 * examples.patch: Modified some of the examples.
     42 * memleak.patch: use mpz_set_ui instead of mpz_init_set_ui on mpz
     43   which is already allocated.
     44 * remove_repl.patch: Do not build/install src/repl at all, since it
     45   does nothing anyway and creating empty archives fails on OS X.
    4146
    4247== Changelog ==
    4348
     49=== iml-1.0.3.p0 (Jeroen Demeyer, 12 June 2013) ===
     50 * #748: Upgrade to latest upstream version, rebase patches.
     51 * Remove rename_lift.patch and sage2.patch, which were upstreamed.
     52 * Removed tinyatlas.patch and #include "tinyatlas.h"
     53 * Removed sage1.patch
     54 * Apply sage3_memleak.patch in all 3 places with similar code, rename
     55   to memleak.patch
     56 * Use -O3 optimization level by default.
     57 * Add configure_default_cflags.patch.
     58
    4459=== iml-1.0.1.p15 (Jean-Pierre Flori, Jeroen Demeyer, 11 June 2013) ===
    4560 * #14699: Cleanup spkg, restore upstream sources, moved patches
    4661   into patch files in patches/

  • patches/build.patch 

    diff --git a/patches/build.patch b/patches/build.patch
    a b  
    1 diff -ruN a/src/Makefile.in b/src/Makefile.in
    2 --- a/src/Makefile.in   2006-11-26 15:45:53.000000000 +0100
    3 +++ b/src/Makefile.in   2013-06-11 08:27:59.432406016 +0200
    4 @@ -94,8 +94,8 @@
    5  AMDEP_TRUE = @AMDEP_TRUE@
    6  AMTAR = @AMTAR@
    7  AR = @AR@
    8 -ATLAS_CFLAGS = @ATLAS_CFLAGS@
    9 -ATLAS_LIBS = @ATLAS_LIBS@
    10 +ATLAS_CFLAGS =
    11 +ATLAS_LIBS =
    12  AUTOCONF = @AUTOCONF@
    13  AUTOHEADER = @AUTOHEADER@
    14  AUTOMAKE = @AUTOMAKE@
    15 diff -ruN a/Makefile.in b/Makefile.in
    16 --- a/Makefile.in       2006-11-26 15:45:52.000000000 +0100
    17 +++ b/Makefile.in       2013-06-11 08:27:59.432406016 +0200
     1diff -ruN src/Makefile.in b/Makefile.in
     2--- src/Makefile.in     2008-07-28 16:53:18.000000000 +0200
     3+++ b/Makefile.in       2013-06-12 14:55:49.462405872 +0200
    184@@ -79,8 +79,8 @@
    195 AMDEP_TRUE = @AMDEP_TRUE@
    206 AMTAR = @AMTAR@
    … …  
    2612 AUTOCONF = @AUTOCONF@
    2713 AUTOHEADER = @AUTOHEADER@
    2814 AUTOMAKE = @AUTOMAKE@
    29 diff -ruN a/configure b/configure
    30 --- a/configure 2006-11-23 22:27:13.000000000 +0100
    31 +++ b/configure 2007-03-06 17:56:30.000000000 +0100
    32 @@ -20040,15 +20040,15 @@
     15diff -ruN src/configure b/configure
     16--- src/configure       2008-06-16 01:52:33.000000000 +0200
     17+++ b/configure 2013-06-12 14:55:49.962394579 +0200
     18@@ -20000,15 +20000,15 @@
    3319 sed 's/^/| /' conftest.$ac_ext >&5
    3420 
    3521 
    … …  
    5440 
    5541 fi
    5642 rm -f conftest.err conftest.$ac_objext \
    57 @@ -20084,23 +20084,23 @@
     43@@ -20044,23 +20044,23 @@
    5844 elif test -n "$atlas_problem"; then
    5945        echo "$as_me:$LINENO: result: problem" >&5
    6046 echo "${ECHO_T}problem" >&6
    … …  
    9581 fi
    9682 
    9783 CFLAGS=${BACKUP_CFLAGS}
     84diff -ruN src/src/Makefile.in b/src/Makefile.in
     85--- src/src/Makefile.in 2008-07-28 16:53:18.000000000 +0200
     86+++ b/src/Makefile.in   2013-06-12 14:55:49.962394579 +0200
     87@@ -94,8 +94,8 @@
     88 AMDEP_TRUE = @AMDEP_TRUE@
     89 AMTAR = @AMTAR@
     90 AR = @AR@
     91-ATLAS_CFLAGS = @ATLAS_CFLAGS@
     92-ATLAS_LIBS = @ATLAS_LIBS@
     93+ATLAS_CFLAGS =
     94+ATLAS_LIBS =
     95 AUTOCONF = @AUTOCONF@
     96 AUTOHEADER = @AUTOHEADER@
     97 AUTOMAKE = @AUTOMAKE@

  • new file patches/configure_default_cflags.patch 

    diff --git a/patches/configure_default_cflags.patch b/patches/configure_default_cflags.patch
new file mode 100644
    - +  
     1diff -ru src/configure b/configure
     2--- src/configure       2008-06-16 01:52:33.000000000 +0200
     3+++ b/configure 2013-06-12 18:12:47.002405386 +0200
     4@@ -18621,8 +18621,7 @@
     5 
     6 
     7 DEFAULT_CFLAGS="-O3 -Wall"
     8-${CFLAGS:=$DEFAULT_CFLAGS}
     9-CFLAGS="-I. ${CFLAGS}"
     10+CFLAGS="-I. ${CFLAGS:-$DEFAULT_CFLAGS}"
     11 
     12 
     13 

  • patches/examples.patch 

    diff --git a/patches/examples.patch b/patches/examples.patch
    a b  
    1717 
    1818   /* generate a n x m random left hand side matrix A */
    1919   n = 5;
    20 -  m = 8;
    21 -  bd = 16;                     /* entris of A satisfying -2^bd < e < 2^bd */
     20-  m = 10;
     21-  bd = 34;                     /* entris of A satisfying -2^bd < e < 2^bd */
    2222+  m = 6;
    2323+  bd = 3;                      /* entris of A satisfying -2^bd < e < 2^bd */
    2424   A = randomLongMat (n, m, bd);

  • .patch 

    diff --git a/patches/sage3_memleak.patch b/patches/memleak.patch
rename from patches/sage3_memleak.patch
rename to patches/memleak.patch
    old new  
    1 --- a/src/nullspace.c   2013-06-10 23:44:52.982405509 +0200
    2 +++ b/src/nullspace.c   2007-10-23 17:59:19.000000000 +0200
    3 @@ -251,7 +251,7 @@
     1diff -ru src/src/nullspace.c b/src/nullspace.c
     2--- src/src/nullspace.c 2008-06-16 00:26:25.000000000 +0200
     3+++ b/src/nullspace.c   2013-06-12 14:28:39.382392511 +0200
     4@@ -109,7 +109,7 @@
    45            for (i = 0; i < m; i++) {
    56                for (j = 0; j < m; j++)
    67                    mpz_init_set_ui(mp_N[i * m + j], 0);
    … …  
    910            }
    1011            *mp_N_pass = mp_N;
    1112        } else {                /* r>0 and s>0 */
     13@@ -253,7 +253,7 @@
     14            for (i = 0; i < m; i++) {
     15                for (j = 0; j < m; j++)
     16                    mpz_init_set_ui(mp_N[i * m + j], 0);
     17-               mpz_init_ui(mp_N[i * m + i], 1);
     18+               mpz_set_ui(mp_N[i * m + i], 1);
     19            }
     20            *mp_N_pass = mp_N;
     21        } else {                /* r>0 and s>0 */
     22@@ -400,7 +400,7 @@
     23            for (i = 0; i < m; i++) {
     24                for (j = 0; j < m; j++)
     25                    mpz_init_set_ui(mp_N[i * m + j], 0);
     26-               mpz_init_set_ui(mp_N[i * m + i], 1);
     27+               mpz_set_ui(mp_N[i * m + i], 1);
     28            }
     29            *mp_N_pass = mp_N;
     30        } else {                /* r>0 and s>0 */

  • deleted file patches/rename_lift.patch 

    diff --git a/patches/rename_lift.patch b/patches/rename_lift.patch
deleted file mode 100644
    + -  
    1 diff -ruN a/src/nonsysolve.c b/src/nonsysolve.c
    2 --- a/src/nonsysolve.c  2006-11-23 22:25:23.000000000 +0100
    3 +++ b/src/nonsysolve.c  2013-06-10 23:07:48.882393429 +0200
    4 @@ -188,7 +188,7 @@
    5  #endif
    6  
    7      /* lifting kincr more steps */
    8 -    C1 = lift(solupos, kincr, n, m, basislen, extbasislen, mp_basisprod, \
    9 +    C1 = iml_lift(solupos, kincr, n, m, basislen, extbasislen, mp_basisprod, \
    10               mp_extbasisprod, liftbasis, cmbasis, extbdcoeff, liftbasisInv, \
    11               mp_r, extbasis, AInv, ARNS);
    12  
    13 @@ -396,7 +396,7 @@
    14    C = NULL;
    15    do {
    16      /* lifting kincr more steps */
    17 -    C1 = lift(solupos, kincr, n, m, basislen, extbasislen, mp_basisprod, \
    18 +    C1 = iml_lift(solupos, kincr, n, m, basislen, extbasislen, mp_basisprod, \
    19               mp_extbasisprod, liftbasis, cmbasis, extbdcoeff, liftbasisInv, \
    20               mp_r, extbasis, AInv, ARNS);
    21  
    22 @@ -617,7 +617,7 @@
    23  #endif
    24  
    25      /* lifting kincr more steps */
    26 -    C1 = lift(solupos, kincr, n, m, liftbasislen, extbasislen, \
    27 +    C1 = iml_lift(solupos, kincr, n, m, liftbasislen, extbasislen, \
    28               mp_liftbasisprod,  mp_extbasisprod, liftbasis, cmliftbasis, \
    29               extbdcoeff, liftbasisInv, mp_r, extbasis, AInv, AExtRNS);
    30  
    31 diff -ruN a/src/padiclift.c b/src/padiclift.c
    32 --- a/src/padiclift.c   2006-11-23 22:25:23.000000000 +0100
    33 +++ b/src/padiclift.c   2013-06-10 23:07:48.882393429 +0200
    34 @@ -446,7 +446,7 @@
    35   */
    36  
    37  Double ***
    38 -lift (const enum SOLU_POS solupos, const long k, const long n, \
    39 +iml_lift (const enum SOLU_POS solupos, const long k, const long n, \
    40        const long m, const long liftbasislen, const long extbasislen, \
    41        const mpz_t mp_basisprod, const mpz_t mp_extbasisprod, \
    42        const FiniteField *liftbasis, const FiniteField *cmbasis, \
    43 diff -ruN a/src/padiclift.h b/src/padiclift.h
    44 --- a/src/padiclift.h   2006-11-23 22:25:24.000000000 +0100
    45 +++ b/src/padiclift.h   2013-06-10 23:07:48.882393429 +0200
    46 @@ -95,7 +95,7 @@
    47                  Double **AInv, FiniteField ***extbasis, Double ***AExtRNS);
    48  
    49  
    50 -Double*** lift(const enum SOLU_POS solupos, const long k, const long n, \
    51 +Double*** iml_lift(const enum SOLU_POS solupos, const long k, const long n, \
    52                const long m, const long liftbasislen, const long extbasislen, \
    53                const mpz_t mp_basisprod, const mpz_t mp_extbasisprod, \
    54                const FiniteField *liftbasis, const FiniteField *cmbasis, \

  • deleted file patches/sage1.patch 

    diff --git a/patches/sage1.patch b/patches/sage1.patch
deleted file mode 100644
    + -  
    1 diff -ruN b/src/RNSop.c a/src/RNSop.c
    2 --- b/src/RNSop.c       2006-11-23 22:25:23.000000000 +0100
    3 +++ a/src/RNSop.c       2013-06-10 23:05:18.872404179 +0200
    4 @@ -46,6 +46,7 @@
    5  
    6  
    7  #include "RNSop.h"
    8 +#include "tinyatlas.h"
    9  
    10  /*
    11   *
    12 diff -ruN b/src/memalloc.c a/src/memalloc.c
    13 --- b/src/memalloc.c    2006-11-23 22:25:23.000000000 +0100
    14 +++ a/src/memalloc.c    2013-06-10 23:05:18.872404179 +0200
    15 @@ -48,13 +48,16 @@
    16  
    17  #include "error.h"
    18  #include "common.h"
    19 +#include "stdio.h"
    20  
    21  void *
    22  xmalloc (size_t num)
    23  {
    24    void * new = malloc(num);
    25 -  if (!new)
    26 -    iml_fatal ("Memory exhausted");
    27 +  if (!new) {
    28 +    printf("%ul\n", num);
    29 +    iml_fatal ("Memory exhausted in xmalloc");
    30 +  }
    31    return new;
    32  }
    33  
    34 @@ -65,8 +68,10 @@
    35    if (!p)
    36      return xmalloc(num);
    37    new = realloc(p, num);
    38 -  if (!new)
    39 -    iml_fatal("Memory exhausted");
    40 +  if (!new) {
    41 +    printf("%ul\n", num);
    42 +    iml_fatal("Memory exhausted in xrealloc");
    43 +  }
    44    return new;
    45  }
    46  
    47 @@ -76,8 +81,10 @@
    48  {
    49  #if HAVE_CALLOC
    50    void * new = calloc(num, size);
    51 -  if (!new)
    52 -    iml_fatal("Memory exhausted");
    53 +  if (!new) {
    54 +    printf("%ul\n", num);
    55 +    iml_fatal("Memory exhausted in xcalloc");
    56 +  }
    57  #else
    58    void * new = xmalloc(num*size);
    59    bzero(new, num*size);
    60 diff -ruN b/src/nullspace.c a/src/nullspace.c
    61 --- b/src/nullspace.c   2006-11-26 04:34:23.000000000 +0100
    62 +++ a/src/nullspace.c   2013-06-10 23:05:18.872404179 +0200
    63 @@ -44,7 +44,6 @@
    64   *
    65   */
    66  
    67 -
    68  #include "nullspace.h"
    69  
    70  /*
    71 @@ -187,3 +186,143 @@
    72      return s;
    73  
    74  }
    75 +
    76 +/*
    77 + * Calling Sequence:
    78 + *   nullspaceLong(n, m, A, mp_N_pass)
    79 + *
    80 + * Summary: Compute the right nullspace of A. In this function A is a
    81 + * 1-dimensional mpz_t array.
    82 + *
    83 + * Input:  n: long, row dimension of A
    84 + *         m: long, column dimension of A
    85 + *         A: 1-dim mpz_t array length n*m, representing n x m matrix
    86 + *            in row major order
    87 + *
    88 + * Output:
    89 + *   - *mp_N_pass: points to a 1-dim mpz_t array of length m*s, where s is the
    90 + *                dimension of the right nullspace of A
    91 + *   - the dimension s of the nullspace is returned
    92 + *
    93 + * Notes:
    94 + *   - The matrix A is represented by one-dimension array in row major order.
    95 + *   - Space for what mp_N_points to is allocated by this procedure: if the
    96 + *     nullspace is empty, mp_N_pass is set to NULL.
    97 + */
    98 +
    99 +long
    100 +nullspaceMP(const long n, const long m, const mpz_t *A, mpz_t * *mp_N_pass)
    101 +{
    102 +    long i, j, k, r, s, *P, *rp, *Pt, *rpt, flag, temp;
    103 +    double *DA;
    104 +    FiniteField p, d = 1;
    105 +    mpz_t *mp_B, *mp_N, mp_D, mp_t1, mp_t2, *C, mp_r;
    106 +
    107 +    mpz_init(mp_r);
    108 +
    109 +    P = XCALLOC(long, n + 1);
    110 +    rp = XCALLOC(long, n + 1);
    111 +    while (1) {
    112 +       p = RandPrime(15, 19);
    113 +       DA = XCALLOC(double, n * m);
    114 +       for (i = 0; i < n * m; i++) {
    115 +           mpz_mod_ui (mp_r, A[i], p);
    116 +           DA[i] = mpz_get_d(mp_r);
    117 +       }
    118 +       for (i = 0; i < n + 1; i++) {
    119 +           P[i] = i;
    120 +           rp[i] = 0;
    121 +       }
    122 +       d = 1;
    123 +       RowEchelonTransform(p, DA, n, m, 1, 1, 0, 0, P, rp, &d);
    124 +       XFREE(DA);
    125 +       r = rp[0];
    126 +       s = m - r;
    127 +       if (s == 0) {
    128 +           *mp_N_pass = NULL;
    129 +       } else if (r == 0) {
    130 +           flag = 1;
    131 +           for (i = 0; i < n * m; i++)
    132 +               if ( mpz_cmp_si(A[i],0) )
    133 +                   flag = 0;
    134 +           if (!flag)
    135 +               continue;
    136 +           mp_N = XCALLOC(mpz_t, m * m);
    137 +           for (i = 0; i < m; i++) {
    138 +               for (j = 0; j < m; j++)
    139 +                   mpz_init_set_ui(mp_N[i * m + j], 0);
    140 +               mpz_init_set_ui(mp_N[i * m + i], 1);
    141 +           }
    142 +           *mp_N_pass = mp_N;
    143 +       } else {                /* r>0 and s>0 */
    144 +
    145 +           Pt = revseq(r, n, P);
    146 +           rpt = revseq(r, m, rp);
    147 +
    148 +           C = XCALLOC(mpz_t, r * r);
    149 +           for (i = 0; i < r; i++)
    150 +               for (j = 0; j < r; j++)
    151 +                   mpz_init_set(C[i * r + j], A[Pt[i] * m + rpt[j]]);
    152 +
    153 +           mp_B = XCALLOC(mpz_t, r * s);
    154 +           for (i = 0; i < r; i++)
    155 +               for (j = 0; j < s; j++)
    156 +                   mpz_init_set(mp_B[i * s + j], A[Pt[i] * m + rpt[r + j]]);
    157 +
    158 +           mpz_init(mp_D);
    159 +           mp_N = XCALLOC(mpz_t, m * s);
    160 +           for (i = 0; i < m * s; i++)
    161 +               mpz_init(mp_N[i]);
    162 +           nonsingSolvLlhsMM(RightSolu, r, s, C, mp_B, mp_N, mp_D);
    163 +           mpz_neg(mp_D, mp_D);
    164 +           for (i = 0; i < s; i++)
    165 +               mpz_set(mp_N[(r + i) * s + i], mp_D);
    166 +
    167 +           XFREE(C);
    168 +           for (i = 0; i < r * s; i++)
    169 +               mpz_clear(mp_B[i]);
    170 +           XFREE(mp_B);
    171 +           mpz_clear(mp_D);
    172 +
    173 +           for (i = r; i >= 1; i--)
    174 +               for (j = 0; j < s; j++)
    175 +                   mpz_swap(mp_N[(i - 1) * s + j],
    176 +                            mp_N[(rp[i] - 1) * s + j]);
    177 +
    178 +           *mp_N_pass = mp_N;
    179 +
    180 +           flag = 1;
    181 +           mpz_init(mp_t1);
    182 +           mpz_init(mp_t2);
    183 +           for (i = r; i < n && flag; i++) {
    184 +               for (j = 0; j < s && flag; j++) {
    185 +                   mpz_set_ui(mp_t2, 0);
    186 +                   for (k = 0; k < m; k++) {
    187 +                       mpz_mul(mp_t1, mp_N[k * s + j],  A[Pt[i] * m + k]);
    188 +                       mpz_add(mp_t2, mp_t2, mp_t1);
    189 +                   }
    190 +                   if (mpz_sgn(mp_t2) != 0)
    191 +                       flag = 0;
    192 +               }
    193 +           }
    194 +           mpz_clear(mp_t1);
    195 +           mpz_clear(mp_t2);
    196 +
    197 +           XFREE(Pt);
    198 +           XFREE(rpt);
    199 +
    200 +           if (!flag) {
    201 +               for (i = 0; i < m * s; i++)
    202 +                   mpz_clear(mp_N[i]);
    203 +               XFREE(mp_N);
    204 +               continue;
    205 +           }
    206 +       }
    207 +       break;
    208 +    }
    209 +    XFREE(P);
    210 +    XFREE(rp);
    211 +
    212 +    return s;
    213 +
    214 +}

  • deleted file patches/sage2.patch 

    diff --git a/patches/sage2.patch b/patches/sage2.patch
deleted file mode 100644
    + -  
    1 # HG changeset patch
    2 # User William Stein <wstein@gmail.com>
    3 # Date 1172736931 28800
    4 # Node ID f0a617a1c36473f86e542406cba3e90778a45c49
    5 # Parent  65361f8749433213043132225730e8aaef9a2890
    6 Fix some memory leaks.
    7 
    8 --- a/src/nullspace.c
    9 +++ b/src/nullspace.c
    10 @@ -273,12 +273,18 @@
    11             mp_N = XCALLOC(mpz_t, m * s);
    12             for (i = 0; i < m * s; i++)
    13                 mpz_init(mp_N[i]);
    14 +
    15 +
    16             nonsingSolvLlhsMM(RightSolu, r, s, C, mp_B, mp_N, mp_D);
    17 +
    18             mpz_neg(mp_D, mp_D);
    19             for (i = 0; i < s; i++)
    20                 mpz_set(mp_N[(r + i) * s + i], mp_D);
    21  
    22 +           for (i = 0; i < r*r; i++)
    23 +               mpz_clear(C[i]);
    24             XFREE(C);
    25 +
    26             for (i = 0; i < r * s; i++)
    27                 mpz_clear(mp_B[i]);
    28             XFREE(mp_B);
    29 @@ -323,6 +329,7 @@
    30      XFREE(P);
    31      XFREE(rp);
    32  
    33 +    mpz_clear(mp_r);
    34      return s;
    35  
    36  }

  • deleted file patches/tinyatlas.patch 

    diff --git a/patches/tinyatlas.patch b/patches/tinyatlas.patch
deleted file mode 100644
    + -  
    1 diff -ruN iml-1.0.1-sage/src/tinyatlas.h src/src/tinyatlas.h
    2 --- iml-1.0.1-sage/src/tinyatlas.h      1970-01-01 01:00:00.000000000 +0100
    3 +++ src/src/tinyatlas.h 2007-03-01 04:11:42.000000000 +0100
    4 @@ -0,0 +1,17 @@
    5 +/*
    6 +Compute Y = alpha * X + beta * Y
    7 +
    8 +where
    9 +   N = degree of each vector
    10 +   incX = X stride
    11 +   incY = Y stride
    12 +*/
    13 +
    14 +void catlas_daxpby(const int N, const double alpha, const double *X,
    15 +const int incX, const double beta, double *Y, const int incY)
    16 +{
    17 +  int i;
    18 +  for(i=0; i < N; i++) {
    19 +    Y[i*incY] = alpha * X[i*incX] + beta * Y[i*incY];
    20 +  }
    21 +}

  • spkg-install 

    diff --git a/spkg-install b/spkg-install
    a b  
    2323    echo "Building a debug version of IML."
    2424    export CFLAGS="-O0 -g $CFLAGS"
    2525else
    26     export CFLAGS="-O2 -g $CFLAGS"
     26    export CFLAGS="-O3 -g $CFLAGS"
    2727fi
    2828
    2929if [ "$SAGE64" = "yes" ]; then

  • spkg-src 

    diff --git a/spkg-src b/spkg-src
    a b  
    44
    55# Make various files executable
    66cd src
    7 chmod ugo+x bootstrap configure
    8 chmod ugo+x config/compile config/depcomp config/install-sh config/ltmain.sh config/missing
     7chmod ugo+x bootstrap
     8chmod ugo+x config/compile config/depcomp config/ltmain.sh config/missing
    99